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研究人员发现超过 4,700 个基因簇对 32 种癌症类型的预后至关重要
西奈山转化疾病模型中心的研究人员发布了一项研究,确定了 4,749 个关键基因簇,称为“预后模块”,它们显着影响 32 种不同类型癌症的进展。
该研究发表在《基因组研究》上,作为综合资源,为开发下一代癌症治疗和诊断标记物奠定了基础。
尽管癌症研究取得了重大进展,但了解该疾病的遗传复杂性仍然具有挑战性。先前的研究通常集中于特定癌症类型中 孤立的基因功能。
“我们的目标是通过对各种癌症形式的基因间相互作用进行全面分析来填补这一知识空白,”威拉德·TC·约翰逊神经遗传学研究教授兼西奈山变革中心主任张斌博士说。疾病建模。
该团队使用多组学方法,将基因组、转录组和表观基因组数据纳入分析中。他们采用先进的系统生物学方法分析了来自最全面的公共癌症数据库之一的癌症基因组图谱 (TCGA) 的 10,000 多个患者样本,并使用严格的网络方法来识别和验证对癌症有重大影响的基因簇预后。
“我们的发现意义深远。我们已经鉴定出 4,749 个不同的共同调控基因模块,它们在癌症进展中发挥着关键作用,”张博士解释道。
遗传学和基因组科学讲师、共同资深作者彭旭博士补充道:“我们的研究不仅仅是识别这些模块。它还阐明了管理其功能的多尺度调控。”
简而言之,该研究已经确定了阻止或促进癌症进展的关键基因及其复杂关系。这一新的认识为未来癌症治疗和诊断方法的针对性研究和开发打开了大门。
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